Hallo Wookkie
Bin neu hier  und von Debian habe ich nicht wirklich eine Ahnung. Aber so  eine Fehlemeldung hatte ich auf AIX.5.2 bzw 5.1. Ich hab's kompilliert in dem ich in CPPFLAGS Variable als erstes den Quellpfad von proftpd angegeben habe.
(zB.:  -I/deine_source_dir/proftpd-1.2.9/include )
Grund:
Meim make braucht er die Datei conf.h, die in include subdir ist (siehe .c files).
Es wird danach gesucht und leider manchmal eine andere conf.h Datei als erstes gefunden (zB. openSSL hat eine); was bei mir nicht wirklich gut war
   :cry:
Nachdem aber die richtige Datei gefunden wurde, hat sich der proftpd kompillieren lassen...
Ich hoffe es hilft dir auch.
cu
mr_hades